新发现！罕见基因融合，劳拉替尼可治
近期《自然》杂志发表日本研究团队的新发现：CLIP1-LTK融合基因，这是全新的非小细胞肺癌驱动基因。CLIP1-LTK融合携带率很低，在非小细胞肺癌中仅为0.4%。临床前研究显示ALK抑制剂劳拉替尼可抑制CLIP1-LTK融合肿瘤，融合基因一例CLIP1-LTK融合非小细胞肺癌患者接受劳拉替尼治疗有效。 仅0.4%的非小细胞肺癌患者携带CLIP1-LTK融合 日本研究团队对多机构肺癌基因组筛查平台(LC-SCRUM-Asia)中已知驱动基因阴性的非小细胞肺癌(NSCLC)样本进行全转录组测序(WTS)。在2020年10月至2020年12月期间分析的75份样本中，在一例患者(1号患者)中识别到染色体12q24上的CLIP1和染色体15q15上的LTK的框内融合转录本。LTK和ALK构成受体酪氨酸激酶的ALK/LTK亚家族，而CLIP1是微管正端追踪蛋白家族的成员。 研究团队使用两组引物进行PCR和逆转录(RT-PCR)去检测1号患者锁骨上淋巴结和肝脏这两个部位转移瘤组织样本中的扩增子，证实编码融合蛋白的转录本存在于该患者的转移瘤中。Sanger测序验证了表达转录本中CLIP1外显子16与LTK外显子11的融合序列。此外，研究团队还进行了分离荧光原位杂交(FISH)分析，进一步验证该患者存在LTK重排。 研究团队利用上述的RT-PCR检测了来自LC-SCRUM-Asia平台的不同类型肺癌患者的572个肿瘤样本，不论其驱动基因状态。CLIP1-LTK融合在检测的30例小细胞肺癌中均为阴性。在分析的542份NSCLC样本中，有两份CLIP1-LTK融合转录本呈阳性( 0.4%)。 目前发现的CLIP1-LTK融合阳性的三个肿瘤(来自1-3号患者的肿瘤)的其他已知的驱动基因检测呈阴性，这表明CLIP1-LTK融合与其他已知的驱动基因是相互排斥的。研究团队还进行了ALK免疫组化分析，已被批准作为检测ALK融合的免疫组化检测方法显示这三个肿瘤ALK融合均为阴性。这三个具有CLIP1-LTK融合的肿瘤在组织学上均被分类为腺癌，三例患者均有吸烟史。
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