除了NovaSeq系统,illumina联手两大科技巨头又出两招
近日,测序巨头Illumina宣布了与皇家飞利浦、IBM的合作协议,旨在共同推进癌症基因组数据的分析和解释。基因表达从合作的内容来看,双方的最终目的是“快”——快速解读数据,帮助研究人员快速实现肿瘤精准医疗。1月10日,Illumina推出最 新测序仪NovaSeq系统的消息刷爆了朋友圈,该系统最引人注目的特点莫过于将基因组测序价格降低至100美元。该系统的使用场景为基因组测序、液体活检、肿瘤/正常组织对照测序、群体基因组测序(PopSeq),为比对肿瘤-健康组织的超级深度测序(ultra-deep sequencing)、与复杂疾病相关的大规模基因变异分析等领域提供全新的市场。
也在1月10日,Illumina在肿瘤精准医疗领域做了另外的两个布局,宣布了与皇家飞利浦、IBM的合作协议,旨在共同推进癌症基因组数据的分析和解释。从合作的内容来看,双方的最终目的是“快”——快速解读数据,快速实现肿瘤精准医疗。
Illumina联合飞利浦提供整合的肿瘤学解决方案
Illumina与飞利浦的战略合作旨在整合Illumina的测序系统和飞利浦的IntelliSpace Genomics临床信息平台,并进行整合后解决方案的营销和销售。
科研人员可以使用BaseSpace Sequence Hub(Illumina的NGS数据管理和分析的云基因组计算环境)获取Illumina测序仪产出的基因组数据,并通过飞利浦的IntelliSpace Genomics肿瘤学解决方案进行处理。该解决方案结合了多个来源的数据,如放射学、免疫组织化学、数字病理学、医疗记录和实验室测试。采用该解决方案的实验室将在一个视图中获得高级分析、深度学习技术、文献、指南和其他证据。
另外,飞利浦和Illumina计划针对美国卫生系统的临床研究进行合作,希望开发肿瘤学的精准医学项目。
飞利浦Connected Care&Health Informatics部门的首席执行官Jeroen Tas说,“到现在为止,使用基因组数据来对癌症进行精确诊断和改善治疗主要集中于学术领域。通过这次合作,我们将为更广泛的实验室和医疗提供者解锁基因组学的价值,帮助他们更快地推进基因组学计划,为患者带来更好的结果。”
Illumina公司总裁兼首席执行官Francisde Souza在一份声明中说:“我们相信,这项合作将为我们的下一代测序系统提供一个完美的途径,将其纳入美国和全球的卫生系统。”
Illumina联手IBM解读癌症基因谱
Illumina与IBM建立了基于Watson系统的合作伙伴关系,在癌症研究中标准化和简化基因组数据的解读。
这两家公司将应用部署Watson for Genomics工具,帮助研究人员解读Illumina的实体肿瘤谱分析结果。科研人员将把Watsonfor Genomics整合到Illumina公司的BaseSpace和肿瘤测序过程中,于是这将允许科学家们使用Illumina的实体肿瘤分析产品TruSight Tumor 170检测多达170个基因的变异,更快速和全面地诠释相关数据。
在短短的几分钟内,Watson for Genomics将读取TruSight Tumor 170生成的遗传信息文件,梳理专业指南、医学文献、临床试验汇编和其他知识来源。然后,系统将生成包含每个基因组改变的注释报告。使用TruSight Tumor 170的Watson for Genomics软件将于今年初上市。
Illumina的肿瘤学副总裁John Leite在一份声明中说:“为了大规模地实现癌症的精确医学,我们需要新的工具来克服基因组研究的数据障碍。我们希望Illumina和Watson的结合,能够提供快速周转的基因组突变结果。”
IBM Watson Health的总经理Deborah DiSanzo在一份声明中说,“这种合作关系为更系统地研究基因组学在肿瘤学中的影响奠定了基础。我们通过扩展从Illumina获得的有价值的基因组测序信息和Watson可靠的、标准化的基因组解读能力,来帮助研究人员实现精准肿瘤学的潜力。”
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