单细胞基因组技术将成为未来生物学的主流
在过去的十年中,分子和细胞技术的发展催生了单细胞基因组学的时代,它允许从单个样本中同时测量数千个“单”细胞中的数千个基因。精准医疗微流体和分子克隆技术的进步通过将分辨率提高到单细胞水平,彻底改变了我们对复杂生物过程的理解。生物科学
人类细胞图谱(HCA)项目代表了一项国际有组织的合作努力,旨在开发涵盖人体所有细胞类型的综合参考数据集1。哺乳动物基因组的功能注释和基因型组织表达(GTEx)consortia用以分析各种人类细胞类型的转录组。多个主要器官的此类公开转录组数据可用作生物学研究的参考,因为它们为小鼠和人类提供单细胞基因组数据。特别是,HCA在数据收集和分析中引入了协调和公平的概念,从而促进了单细胞基因组学。
单细胞
基于单细胞基因组分析技术,我们可以正确识别细胞类型,这在发育生物学和细胞治疗领域至关重要。细胞类型的组织学描述将被基于生物标志物和分子特征的细胞分型所取代。单细胞RNA测序和空间转录组分析的最新进展极大地改变了我们对细胞类型的理解。
定量分子分析与对癌细胞表型多样性的研究相结合,需要开发计算工具。对癌症发展和进展的潜在细胞类型和状态的无监督分析可以为临床结果提供新的见解。特别是,患者单细胞转录组数据的计算分析可能需要一个强大而连贯的管道,才能将此类方法应用于转化研究和临床精准医学。
单细胞测序技术
由于以下原因,用于单细胞测序的新鲜肿瘤组织的正确采集和分离有时会受到限制:(1)由于组织采集发生在精确的病理诊断之前,因此对于病变是否包含感兴趣的转移性肿瘤存在不确定性;
(2)微创活检技术,例如经皮针吸,对于转移性病变通常优于手术活检;然而,这些微创技术可能无法确保足够的组织用于组织学诊断和单细胞测序。
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